Morcegos dependem de árvores. É verdadeiro dizer que onde encontram-se árvores pode-se observar alguma espécie de morcego. A distribuição mundial das quase 1.000 espécies de morcegos demonstra que só não são encontradas nos polos. Várias espécies de vegetais dependem dos morcegos para a sua sobrevivência, seja para carregar o pólen de uma flor a outra, como também espalhar as sementes, incrementando as chances de germinar um novo exemplar. Durante a evolução a dependência de alguns vegetais e algumas espécies de morcegos mostrou-se cada vez mais interligada. Exemplo disto é a existência de algumas flores que só abrem a noite para impedir que outros polinizadores, como abelhas e aves as visitem.
			Várias espécies de frutos são largamente empregadas por morcegos em meio urbanos, dentre as quais podemos citar : Sapucaia, Figueiras, Sapotizeiro, Goiabeira, Jamelão, Amêndoa-da-Praia, Cajá, Manga, etc. Algumas flores são avidamente procuradas pelos morcegos, entre as quais podemos citar : Bananeira, Agave, Maracujá-da-Praia, Unha-de-Vaca. Mas os morcegos não dependem dos vegetais apenas para obter o alimento de que necessitam. Várias espécies utilizam as plantas para seu refúgio. Sob a superfície de folhas, entre ramos, entre folhas secas, em ocos ou até mesmo em cascas podem ser encontradas refugiadas algumas espécies de morcegos. Alguns moradores para evitar a proximidade de morcegos durante a época de floração ou frutificação de algumas plantas solicitam a poda ou a remoção destas árvores. No entanto, isto também não é desejável, pois as plantas são extremamente importantes para a amenização da temperatura e prover sombra. Além disto, remover a fonte de alimento pode causar o aumento de entradas de morcegos, atrás de alimentos, nas residências.